Quimerismo

El análisis de quimerismos moleculares, resultantes de un trasplante alogénico, se ha convertido en un método bien establecido para controlar la evolución del trasplante de médula ósea y para evaluar el riesgo de recaída.

Con los kits imegen-Quimera se puede determinar la presencia de quimerismos hematopoyéticos en el periodo post-trasplante mediante la cuantificación de polimorfismos de inserción/deleción (INDELs) o alelos nulos, respecto a la cantidad total de ADN presente en la muestra. Para realizar dicha cuantificación es necesario analizar un gen de referencia, β-globina, y un polimorfismo informativo. Se considera que un polimorfismo es informativo cuando se detecta en el receptor del trasplante y no en el donante.

Para encontrar un polimorfismo informativo primero es necesario hacer un screening y una vez identificado el polimorfismo informativo, haremos la cuantificación del mismo por RT-PCR o PCR digital.

 

PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS

  • No requiere muestra previa del receptor.
  • Screening por RT-PCR.
  • Cuantificación polimorfismo por RT-PCR o PCR Digital.
  • Resultados validados y fiables con marcado CE-IVD.
  • Software para generar base de datos, análisis, seguimiento, acciones médicas…

Documentación relacionada

Gamas

Quimerismo por RT-PCR

Tras la extracción del DNA con el de screening se hace el genotipado para la detección de alelos informativos, una vez identificados se procede a la cuantificación relativa de los mismos con los kits específicos por RT-PCR.

El kit de screening, imegen-Quimera Screening Multiplex I, permite el análisis de 16 polimorfismos de inserción/deleción (INDELs) distintos mediante PCR Multiplex a tiempo real para posterior cuantificación por RT-PCR. Los polimorfismos SRY y RhD no se han incluido en el panel de screening ya que no es necesario su análisis molecular para determinar la informatividad. El SYR es informativo cuando el receptor es varón y la donante mujer. Y el RhD es informativo cuando el receptor tiene grupo sanguíneo Rh+ y el donante Rh-. La informatividad global acumulada en este panel, junto con los polimorfismos SRY y RhD, es del 96%.

En caso de detectar un polimorfismo informativo, positivo en el receptor y negativo en donante, con la finalidad de controlar la evolución del trasplante y de evaluar el riesgo de recaída, se recomienda adquirir el kit de cuantificación específico, imegen-Quimera (RT-PCR), relacionado con dicho polimorfismo.

 

Este kit permite la cuantificación relativa cuando el polimorfismo o INDEL diana está presente en más del 0,1% del DNA total de la muestra. Por tanto el límite de cuantificación de todos los kits es 0,1%.

Cada kit contiene: dos sondas marcadas con FAM y VIC (una para la detección del INDEL y otra para el gen de referencia β-globina), los oligonucleótidos de amplificación y además incluye un estándar (plásmido sintético diseñado por Imegen) que actuará como calibrador y permitirá la cuantificación relativa de los INDEL, así como el control de la evolución del trasplante, esto es una ventaja, ya que no es necesario utilizar la muestra pre-trasplante del receptor ni ninguna anterior al seguimiento.

 

REFERENCIAS

Referencia Descripción Formato

Referencia

Descripción

Formato

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imegen-Quimera Screening Multiplex I

10 muestras

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Set imegen-Quimera SRY

25 muestras

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Set imegen-Quimera RhD

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-3I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-4I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-5I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-6I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-7I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-8I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-9I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-10I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-11I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-12I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-4D

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-5D

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-10D

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-23I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-20I

25 muestras

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Set imegen-Quimera Q116-12D

25 muestras

  • Marcado CE-IVD.
  • Kit de screening por RT-PCR, con informatividad del 96%.
  • Kit de cuantificación por RT-PCR, LOQ 0,1%.
  • Ambos kits compatibles con equipos RT-PCR (FAM/VIC o HEX).
  • No requiere muestra previa del receptor.
  • Técnica muy sensible, rápida (resultados en 3 horas) y de fácil interpretación.
  • Software para generar base de datos, análisis de resultados, seguimientos, control de acciones médicas…
Quimerismo por PCR Digital

Tras la extracción del DNA con el de screening se hace el genotipado para la detección de alelos informativos, una vez identificados se procede a la cuantificación absoluta de los mismos con los kits específicos por PCR Digital.

El kit de screening, imegen-Quimera Screening Multiplex Plus, permite el análisis de 16 polimorfismos de inserción/deleción (INDELs) distintos mediante PCR Multiplex a tiempo real para análisis de quimeras por PCR Digital. Los polimorfismos SRY y RhD no se han incluido en el panel de screening ya que no es necesario su análisis molecular para determinar la informatividad. El SYR es informativo cuando el receptor es varón y la donante mujer. Y el RhD es informativo cuando el receptor tiene grupo sanguíneo Rh+ y el donante Rh-. La informatividad global acumulada en este panel, junto con los polimorfismos SRY y RhD, es del 99,1%.

En caso de detectar un polimorfismo informativo, positivo en el receptor y negativo en donante, con la finalidad de controlar la evolución del trasplante y de evaluar el riesgo de recaída, se recomienda adquirir el kit de cuantificación, imegen-Quimera (PCR Digital), relacionado con dicho polimorfismo.

El kit imegen-Quimera (PCR Digital) permite la cuantificación cuando el polimorfismo diana o INDEL está presente en más del 0,05% del ADN total de la muestra. Por tanto, el límite de cuantificación de todos los kits es 0,05%.

Existen dos formatos DRY o LIQUID.

El formato DRY es compatible tanto con el equipo QuantStudio 3D Digital PCR System (Thermo Fisher Scientific) como con los equipos QX200 o QX100 Droplet Digital PCR System (BIO-RAD). El kit contiene liofilizados los oligonucleótidos de amplificación y las sondas: una marcada con VIC  para la β-globina (gen de referencia) y otra con FAM para el INDEL específico.

El formato LIQUID sólo es compatible con el equipo QuantStudio 3D Digital PCR System (Thermo Fisher Scientific). El kit contiene los oligonucleótidos de amplificación y las sondas: una marcada con VIC  para la β-globina (gen de referencia) y otra con FAM para el INDEL específico. Además se incluye fluido de inmersión (jeringa y punta de plástico), 12 Chips 20K (base y tapa) y un dispositivo de carga de muestras.

 

REFERENCIAS

Referencia Descripción Formato

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Set imegen-Quimera Screening Multiplex Plus

10 muestras

IMG-116-27 DRY

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Set imegen-Quimera SRY

12 muestras

IMG-116-28 DRY

IMG-116-28

Set imegen-Quimera RhD

12 muestras

IMG-116-32 DRY

IMG-116-32

Set imegen-Quimera Q116-6I

12 muestras

IMG-116-29 DRY

IMG-116-29

Set imegen-Quimera Q116-3I

12 muestras

IMG-116-33 DRY

IMG-116-33

Set imegen-Quimera Q116-7I

12 muestras

IMG-116-36 DRY

IMG-116-36

Set imegen-Quimera Q116-12D

12 muestras

IMG-116-34 DRY

IMG-116-34

Set imegen-Quimera Q116-11I

12 muestras

IMG-116-31 DRY

IMG-116-31

Set imegen-Quimera Q116-5I

12 muestras

IMG-116-30 DRY

IMG-116-30

Set imegen-Quimera Q116-4I

12 muestras

IMG-116-35 DRY

IMG-116-35

Set imegen-Quimera Q116-10I

12 muestras

IMG-116-37 DRY

IMG-116-37

Set imegen-Quimera Q116-23I

12 muestras

IMG-116-42 DRY

IMG-116-42

Set imegen-Quimera Q116-28I

12 muestras

IMG-116-46 DRY

IMG-116-46

Set imegen-Quimera Q116-32I

12 muestras

IMG-116-45 DRY

IMG-116-45

Set imegen-Quimera Q116-31I

12 muestras

IMG-116-44 DRY

IMG-116-44

Set imegen-Quimera Q116-30D

12 muestras

IMG-116-43 DRY

IMG-116-43

Set imegen-Quimera Q116-29D

12 muestras

IMG-116-41 DRY

IMG-116-41

Set imegen-Quimera Q116-27D

12 muestras

IMG-116-38 DRY

IMG-116-38

Set imegen-Quimera Q116-24I

12 muestras

 

  • Marcado CE-IVD.
  • Kit screening por RT-PCR, con informatividad del 99,1%. Compatible con equipos RT-PCR (FAM/VIC o HEX).
  • Kit cuantificación por PCR Digital, LOQ 0,05%. Compatible con QuantStudio 3D Digital PCR.
  • No es necesario hacer ni curva estándar, ni calibración, ni réplicas (1 chip por muestra).
  • Tolera mejor la presencia de inhibidores de PCR.
  • NO REQUIERE MUESTRA PREVIA DEL PACIENTE.
  • MAYOR PRECISIÓN asociada a la técnica de PCR Digital.
  • Software para generar base de datos, análisis de resultados, seguimientos, control de acciones médicas…

 

El principal beneficio de la PCR Digital, frente a RT-PCR y otras técnicas, es la PRECISIÓN debido a que la tasa de error asociada a la técnica de PCR Digital es del 5% frente al 25% de la RT-PCR. Esto implica que la PCR Digital es capaz de detectar cambios muy pequeños, que con la RT-PCR podrían pasar inadvertidos, por lo que el diagnóstico se adelanta en el tiempo y que es de vital importancia para el paciente y para determinar las acciones médicas correspondientes.

Quimerismo PCR Digital

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