Investigación

DNA Seq/cfDNA Seq

Nuestra representada Bioo Scientific ofrece una completa línea de kits de preparación de librerías compatibles con las plataformas de Illumina y Ion Torrent.

Los kits NEXTflex™ permiten una amplia gama de aplicaciones como secuenciación de genoma completo, resecuenciación dirigida, descubrimiento de mutaciones e identificación de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP).

PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS

  • Tecnología mejorada en  la etapa de ligación que permite gran número de secuencias únicas.
  • Alta capacidad de multiplexeado: hasta 384 barcodes en single index.
  • Etapa de amplificación altamente eficaz gracia a una enzima optimizada que permite obtener coberturas uniformes en secuencias ricas en GC.
  • Protocolos automatizables.

BENEFICIOS

  • Amplio rango de formatos.
  • Kits modulares.
  • Protocolos sencillos.

 

Gamas

NEXTFLEX® Rapid XP DNA-Seq es un kit rápido que permite preparar librerías en tan solo 2 horas y a partir de rangos de 1ng a 1µg.

El kit incorpora la enzima de fragmentación y permite llevar a cabo de una manera muy eficiente la fragmentación enzimática, end repair y adenilación en una sola reacción.

Su efectivo flujo de trabajo produce librerías de ADN de alto rendimiento, consistentes, alta cobertura, bajas tasas de duplicación y bajo sesgo de GC.

 

REFERENCIAS

Referencia Descripción Formato
NOVA 5149-02 NEXTflex™ Rapid XP DNA Sequencing Kit 48 rxns
  Barcodes para usar con menos de 10ng de DNA  
NOVA-514120 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 6 48 rxns
NOVA-514121 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 12 96 rxns
NOVA-514122 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 24 192 rxns
NOVA-514123 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 48 384 rxns
NOVA-514124 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 96 768 rxns
  Barcodes para usar con 10ng o más de DNA  
NOVA-514101 NEXTflex™ DNA Barcodes - 6 48 rxns
NOVA- 514102 NEXTflex™ DNA Barcodes - 12 96 rxns
NOVA- 514103 NEXTflex™ DNA Barcodes - 24 192 rxns
NOVA-514104 NEXTflex™ DNA Barcodes - 48 384 rxns
NOVA-514105 NEXTflex™ DNA Barcodes - 96 768 rxns
  Barcodes HT  
NOVA 514170 NEXTFLEX-HT™ Barcodes- 6 48 rxns
NOVA 514174 NEXTFLEX-HT™ Barcodes 1-96 Placa de 96
NOVA 514175 NEXTFLEX-HT™ Barcodes 97-192 Placa de 96
NOVA 514176 NEXTFLEX-HT™ Barcodes 193-288 Placa de 96
NOVA 514177 NEXTFLEX-HT™ Barcodes 289-384 Placa de 96
  Dual Index Barcodes  
NOVA 514160 NEXTFLEX® Dual-Indexed DNA Barcodes 1-96 768 rxns
NOVA 514161 NEXTFLEX® Dual-Indexed DNA Barcodes 97-192 768 rxns
  Unique Dual Index Barcodes  
NOVA 514150 NEXTFLEX® Unique Dual Index Barcodes 1-96 Placa de 96
NOVA 514151 NEXTFLEX® Unique Dual Index Barcodes 97-192 Placa de 96

 

 

 

 

  • Input de DNA flexible desde 1ng a 1 µg.
  • Incorpora la tecnología mejorada de la etapa de ligación.
  • Amplificación altamente eficaz gracias a una enzima optimizada que permite obtener coberturas uniformes en secuencias ricas en GC.
  • El kit incluye la enzima de fragmentación y los beads de limpieza/selección de tamaño.
  • Generación de fragmentos de DNA de tamaño uniforme.
  • Fragmentación/end-repair /adenilación en un solo paso.
  • Compatible con plataformas Illumina.
  • Compatible con todos los códigos de barras NEXTFLEX®.
  • Capacidad de multiplexación de hasta 384 single index.

 

  • Proceso de 2 horas con mínima manipulación.
  • Automatización sencilla.

 

NEXTflex Cell™ Free DNA Seq  produce librerías a partir de 1 ng de DNA circulante , DNA células tumorales o DNA de células fetales en tan solo 2 horas.

 

REFERENCIAS

Referencia Descripción Formato
5150-01 NEXTflex™ Cell Free DNA-Seq Kit 8 reacciones
5150-02 NEXTflex™ Cell Free DNA-Seq Kit 48 reacciones
514101 NEXTflex™ DNA Barcodes - 6 48 reacciones
514102 NEXTflex™ DNA Barcodes - 12 96 reacciones
514103 NEXTflex™ DNA Barcodes - 24 192 reacciones
514104 NEXTflex™ DNA Barcodes - 48 384 reacciones
514105 NEXTflex-96™ DNA Barcodes - 96 768 reacciones
514160 NEXTflex™ Dual-Indexed DNA Barcodes 768 reacciones
514161 NEXTflex™ Dual-Indexed DNA Barcodes 768 reacciones

 

PUBLICACIONES

  • Xia, S. et al. (2015) Genomic variations in plasma cell free DNA differentiate early stage lung cancers from normal controls. Lung Cancer. doi: 10.1016/j.lungcan.2015.07.002.

 

  • Permite trabajar desde un input de  1ng.
  • Incorpora la tecnología mejorada de la etapa de ligación.
  • Compatible con las plataformas MiSeq, HiSeq,NextSeq y HiSeqX ten.
  • Opciones de Barcode flexible hasta 384 single index.

 

  • Proceso de 2 horas con mínima manipulación.
  • Automatización sencilla.

 

NEXTflex™ Chip-Seq permite preparar librerías con muy baja cantidad y calidad de DNA. Con 1ng de inmunoprecipitado con cromatina o DNA Genómico se obtienen librerías para secuenciar en single read o paired-end sequencing.

 

REFERENCIAS

Referencia Descripción Formato
5143-01 NEXTflex™ ChIP-Seq Kit 8 reacciones
5143-02 NEXTflex™ ChIP-Seq Kit 48 reacciones
514120 NEXTflex™ ChIP-Seq Barcodes - 6 48 reacciones
514121 NEXTflex™ ChIP-Seq Barcodes - 12 96 reacciones
514122 NEXTflex™ ChIP-Seq Barcodes - 24 192 reacciones
514123 NEXTflex™ ChIP-Seq Barcodes - 48 384 reacciones
514124 NEXTflex™ ChIP-Seq Barcodes - 96 768 reacciones

 

  • Permite trabajar desde un input de  1ng.
  • Incorpora la tecnología mejorada de la etapa de ligación.
  • Compatible con las plataformas MiSeq, HiSeq,NextSeq y HiSeqX ten.
  • Opciones de Barcode flexible hasta 96single index.

 

  • Sin etapas de geles.
  • Automatización sencilla.

 

El kit Nextflex™ mtDNA Seq incluye los reactivos optimizados para el aislamiento de DNA mitocondrial y preparación de librería  paired-end o single read desde 2-4µg de DNA genómico. Este kit se ha desarrollado usando la tecnología publicada en “Nucleic Acids Research: Stable Heteroplasmy at the Single-cell Level is Facilitated by Intercellular Exchange of mtDNA”.

 

REFERENCIAS

 

Referencia Descripción Formato
5280-01 NEXTflex™ mtDNA-Seq Kit 8 reacciones
5280-02 NEXTflex™ mtDNA-Seq Kit 48 reacciones
514120 NEXTflex™ ChIP-Seq Barcodes - 6 48 reacciones
514121 NEXTflex™ ChIP-Seq Barcodes - 12 96 reacciones
514122 NEXTflex™ ChIP-Seq Barcodes - 24 192 reacciones
514123 NEXTflex™ ChIP-Seq Barcodes - 48 384 reacciones
514124 NEXTflex-96™ ChIP-Seq Barcodes  768 reacciones

 

ARTICULOS

  • Jayaprakash, A. D., et al. (2015) Stable heteroplasmy at the single-cell level is facilitated by intercellular exchange of mtDNA. Nucl. Acids Res. doi: 10.1093/nar/gkv052.

 

  • Permite secuenciar dianas de DNA mitocondrial.
  • Ofrece tanto el aislamiento del mtDNA como la preparación de librería en un flujo de trabajo sencillo.

 

  • Produce un mayor número de lecturas únicas comparada con la tradicional PCR.
  • Permite el análisis de heteroplasmia.
  • Permite  incremento del multiplexeado.

 

El kit Nextflex™  PCRFree Seq  Permite preparar librerias sin necesidad de realizar PCR reduciendo en gran medida el sesgo que produce esta etapa. Se obtiene  un mejor mapeo de lectura y la reducción de secuencias duplicadas permitiendo una reducción del coste de secuencia y un mejor ensamblaje de novo.

 

REFERENCIAS

Referencia Descripción Formato
5142-01 NEXTflex™ PCR-Free DNA Sequencing Kit 8 reacciones
5142-02 NEXTflex™ PCR-Free DNA Sequencing Kit 48 reacciones
514110 NEXTflex™ PCR-Free DNA Barcodes - 6 48 reacciones
514111 NEXTflex™ PCR-Free DNA Barcodes - 12 96 reacciones
514112 NEXTflex™ PCR-Free DNA Barcodes - 24 192 reacciones
514113 NEXTflex™ PCR-Free DNA Barcodes - 48 384 reacciones
514012 Agarose Gel Size Selection Kit  10 gel isolations
514013 Agarose Gel Size Selection Kit  50 gel isolations

 

  • Desde 500ng de DNA
  • Permite incorporar barcodes de 6, 12,24 o 48
  • Alta eficacia en la etapa de ligación gracias a la tecnología NEXTFlex™ Ligation

 

  • Reduce las secuencias duplicadas
  • Mejor ensamblaje de novo
  • Permite la automatización

 

El kit Nextflex™ DNA Seq para plataforma Ion Torrent permite preparar librerías basadas en ChiP y DNA Seq. Gracias a la tecnología de ligación patentada por Bioo  se obtiene una gran eficiencia  con gran número de lecturas de secuencia única.

 

REFERENCIAS

Referencia Descripción Formato
4001-01 NEXTflex™ DNA-Seq Kit - Ion Torrent Compatible 8 reacciones
4001-02 NEXTflex™ DNA-Seq Kit - Ion Torrent Compatible 48 reacciones
401001 NEXTflex™ DNA Barcodes - Ion Torrent Compatible - 8 48 reacciones
401002 NEXTflex™ DNA Barcodes - Ion Torrent Compatible - 16 96 reacciones
401003 NEXTflex™ DNA Barcodes - Ion Torrent Compatible - 32 192 reacciones
401004 NEXTflex™ DNA Barcodes - Ion Torrent Compatible - 64 384 reacciones

 

ARTICULOS

  • Appenzeller, S. et al. (2015) Immunoglobulin rearrangement analysis from multiple lesions in the same patient using Next Generation Sequencing. Histopathology. doi: 10.1111/his.12714

 

  • Compatible con Ion S5, Ion S5 XL, Ion Torrent PGM, y  Ion Proton.
  • Permite incorporar distintos formatos de barcode 8, 16,32, y 64.
  • Formato de placa de 96 para un alto volumen de procesamiento de muestras.

 

  • Permite automatización.
  • Amplio número de formatos.

 

Nextflex Rapid DNA seq ofrece un rápido kit para preparar librerías  a partir de tan poca cantidad como 1ng en tan solo 2 horas. Ideal para usar con DNA genómico, muestras de FFPE, ChiP DNA, previa preparación a captura y pools de amplicones . El kit permite trabajar en rangos de 1ng a 1µg de DNA. El protocolo permite trabajar con selección de tamaño sin necesidad de usar geles.

 

REFERENCIAS

 

Referencia Descripción Formato
5144-01 NEXTflex™ Rapid DNA Sequencing Kit 8 reacciones
5144-02 NEXTflex™ Rapid DNA Sequencing Kit 48 reacciones
5144-03 NEXTflex™ Rapid DNA-Seq Kit Bundle with DNA Barcodes 1 - 24 48 reacciones
5144-04 NEXTflex™ Rapid DNA-Seq Kit Bundle with DNA Barcodes 25 - 48 48 reacciones

 

Barcodes para usar con menos de 10ng de DNA

Referencia Descripción Formato
514120 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 6 48 reacciones
514121 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 12 96 reacciones
514122 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 24 192 reacciones
514123 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 48 384 reacciones
514124 NEXTflex-96™ ChIP-seq Barcodes 768 reacciones

 

Barcodes para usar con 10ng o más de  DNA 

Referencia Descripción Formato
514101 NEXTflex™ DNA Barcodes - 6 48 reacciones
514102 NEXTflex™ DNA Barcodes - 12 96 reacciones
514103 NEXTflex™ DNA Barcodes - 24 192 reacciones
514104 NEXTflex™ DNA Barcodes - 48 384 reacciones
514105 NEXTflex™ DNA Barcodes - 96 768 reacciones

 

  • Input DNA flexible desde 1ng a 1 µg.
  • Incorpora la tecnología mejorada de la etapa de ligación.
  • Compatible con las plataformas MiSeq, HiSeq,NextSeq y HiSeqX ten.
  • Opciones de Barcode flexible hasta 384 single index.

 

  • Proceso de 2 horas con mínima manipulación.
  • Automatización sencilla.

 

Nextflex Rapid DNA seq 2.0 es un kit que permite preparar librerías en tan solo 2 horas en rangos de 1ng a 1µg de DNA. Este kit incluye los reactivos, adaptadores y beads necesarios durante el flujo de trabajo y su protocolo permite trabajar con selección de tamaño sin necesidad de usar geles.

La química de este kit está mejorada respecto a las versiones anteriores de Nextflex Rapid DNA lo que implica un incremento del rendimiento de las librerías de dos a tres veces.

 

REFERENCIAS

Referencia Descripción Formato
NOVA-5188-01 NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 8 rxn
NOVA-5188-02 NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 48 rxn
NOVA-5188-03 NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 96 rxn
NOVA-5188-11 NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 (with NEXTFLEX-HT™ barcodes) 8 rxn
NOVA-5188-12 NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 (with NEXTFLEX-HT™ barcodes) 48 rxn
NOVA-5188-13 NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 (with NEXTFLEX-HT™ barcodes) 96 rxn
  Barcodes para usar con menos de 10ng de DNA  
NOVA-514120 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 6 48 rxns
NOVA-514121 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 12 96 rxns
NOVA-514122 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 24 192 rxns
NOVA-514123 NEXTflex™ ChIP-seq Barcodes - 48 384 rxns
NOVA-514124 NEXTflex-96™ ChIP-seq Barcodes 768 rxns
  Barcodes para usar con 10ng o más de  DNA   
NOVA-514101 NEXTflex™ DNA Barcodes - 6 48 rxns
NOVA- 514102 NEXTflex™ DNA Barcodes - 12 96 rxns
NOVA- 514103 NEXTflex™ DNA Barcodes - 24 192 rxns
NOVA-514104 NEXTflex™ DNA Barcodes - 48 384 rxns
NOVA-514105 NEXTflex™ DNA Barcodes - 96 768 rxns
  Barcodes HT  
NOVA 514170 NEXTFLEX-HT™ Barcodes- 6 48 rxns
NOVA 514174 NEXTFLEX-HT™ Barcodes 1-96 Placa de 96
NOVA 514175 NEXTFLEX-HT™ Barcodes 97-192 Placa de 96
NOVA 514176 NEXTFLEX-HT™ Barcodes 193-288 Placa de 96
NOVA 514177 NEXTFLEX-HT™ Barcodes 289-384 Placa de 96
  Dual Index Barcodes  
NOVA 514160 NEXTFLEX® Dual-Indexed DNA Barcodes 1-96 768 rxns
NOVA 514161 NEXTFLEX® Dual-Indexed DNA Barcodes 97-192 768 rxns
  Unique Dual Index Barcodes  
NOVA 514150 NEXTFLEX® Unique Dual Index Barcodes 1-96 Placa de 96
NOVA 514151 NEXTFLEX® Unique Dual Index Barcodes 97-192 Placa de 96

 

 

  • Input DNA flexible desde 1ng a 1 µg.
  • Incorpora la tecnología mejorada de la etapa de ligación.
  • Amplificación altamente eficaz gracias a una enzima optimizada que permite obtener coberturas uniformes en secuencias ricas en GC.
  • Mayor rendimiento de las librerías.
  • Mayor calidad de los datos de secuenciación: mayor cobertura del genoma, menor sesgo GC, mitigación de la tasa de duplicación.
  • Flujo de trabajo compatible libre de PCR.
  • El kit incluye los beads de limpieza/selección de tamaño.
  • Compatible con plataformas Illumina.
  • Compatible con todos los códigos de barras NEXTFLEX®.
  • Capacidad de multiplexación de hasta 384 single index y de hasta 192 dual index ó unique dual index.

 

  • Proceso de 2 horas con mínima manipulación.
  • Automatización sencilla.

 

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