ARN

Las soluciones de MGI para la preparación de librerías de ARN proporcionan una solución eficiente para la generación de librerías de ARN partiendo de un ámplio rango de ARN total (10ng-1µg).

Son compatibles con las plataformas de secuenciación de alto rendimiento de MGI, además de con los equipos automáticos de preparación de muestras MGISP.

Además del kit de preparación de librerías de ARN universal, MGI nos ofrece su kit de depleción de ARN ribosomal, un kit direccional de preparación de librería, un kit de preparación de librerías de ARN pequeño y un kit de exomas de ARN.

 

PRINCIPAL CARACTERÍSTICA

  • Basados en tecnología DNBSEQ.

 

BENEFICIOS

  • Alta calidad de secuencias.
  • Reducción tasa duplicados.
  • Reducción Index Hopping.

 

TABLA DE SELECCIÓN DE KITS

Método Kit de preparación Depleción/ Enriquecimiento Comentarios
 RNA-Seq  RNA Library Prep Set  Poly A + Enriquecimiento  Identificar expresión genes
 Transcriptoma  Directional RNA Library Prep Set  Depleción rRNA  Expresión genes, splicing y lncRNA
 Small RNA  Small RNA Library Prep  Selección mediante beads o gel  Identificar ARN <30bp

 

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Gamas

Este kit es compatible con un amplio rango de muestras, tanto humanas como de animales y plantas, además de microorganismos. Proporciona un análisis rápido y completo de cambios en la expresión de genes, examinando raros y nuevos transcritos, descubriendo nuevos eventos de splicing alternativo, fusión de genes, SNPs y expresión alelo específica.

 

APLICACIONES RECOMENDADAS

Tipo muestra Método de enriquecimiento de ARN Longitud de lectura Aplicación

ARN total eucariótico con una alta integridad

Poly(A)+ mRNA enriquecido mediante oligo(dT) beads

SE50/PE100/PE150

Cuantificación de mRNA y análisis del transcriptoma

ARN total procariótico

rRNA eliminado con rRNA depletion kit

SE50/PE100/PE150

Cuantificación de ARN y análisis del transcriptoma

Muestras FFPE con el ARN degradado, RNA de plasma cell-free, etc..

rRNA eliminado con rRNA depletion kit

SE50/PE100

Cuantificación de ARN y análisis del transcriptoma

 

ESPECIFICACIONES DEL PRODUCTO

Nombre del kit MGIEasy RNA Library Prep Set
 Versión  V. 3.0
 Reacciones/ Kit  16 RXN (1000006383) / 96 RXN (1000006384)
 Cantidad inicial  10 ng - 1µg de ARN total
 Tipo de muestra  Tejido y muestras FFPE
 Compatibilidad de especies  Humana, animales, plantas, hongos y bacterias
 Tiempo de ensayo  7 horas
 Aplicaciones  RNA-seq, secuenciación del transcriptoma
 Plataformas compatibles  DNBSEQ-G50, DNBSEQ-G400
 Longitud lectura recomendada  SE50/PE100/PE150
 Datos de secuenciación recomendados por muestra  25M datos crudos (SE50) / 8Gb datos crudos (PE100/PE150)

 

  • Amplio rango de ARN total inicial: compatible con alto rango de ARN total inicial (10ng-1µg) exhibiendo una excelente calidad en los datos de secuenciación y en la anotación del transcrito.
  • Excelente cobertura: proporciona un ensamblado de los transcritos correcto y complete.
  • Fácil de usar: protocolo simple y compatible con equipos de preparación de librerías automático.
  • Compatible con varios tipos de muestra: incluyendo ARN de baja calidad, ARN en FFPE y muestras de plasma.
  • Alta uniformidad: es capaz de detectar transcritos completos sin sesgo en los extremos.
  • Solución flexible: Existen varios métodos de enriquecimiento de ARN y varias longitudes de lectura para satisfacer las necesidades en todo tipo de muestras.

 

Este kit es capaz de eliminar eficientemente el ARN ribosomal de una muestra de ARN total manteniendo así el mRNA y el RNA no codificante e incrementando la proporción de datos útiles. Elimina rRNA de muestras humanas a partir de una cantidad inicial de total RNA desde 10ng a 1µg. Este kit es también compatible con muestras de ARN degradadas (ej, FFPE RNA).

 

ESPECIFICACONES DE PRODUCTO

Nombre del kit MGIEasy rRNA Depletion Kit
 Versión  V. 1.1
 Reacciones/ Kit  32 RXN (1000005953)
 Cantidad inicial  10 ng - 1µg de ARN total
 Tipo de muestra  Tejido, plasma y muestras FFPE
 Compatibilidad de especies  Humana, ratón, rata
 Tiempo de ensayo  2 horas
 Aplicaciones  Secuenciación del transcriptoma, secuenciacion del ARN total, LncRNA
 Datos de secuenciación recomendados por muestra  25M datos crudos (SE50) / 8Gb datos crudos (PE100/PE150)

 

  • Baja cantidad de ARN inicial: Necesita solamente 10 ng de ARN total por muestra.
  • Elimina eficientemente el rRNA: Elimina el 99% del rRNA convervando el mRNA y el RNA no codificante.
  • Solución flexible: es una solución flexible y compatible con varios kit de preparación de librerías de ARN.
  • Compatible con diferentes tipos de muestras: incluyendo ARN de baja calidad, ARN en FFPE y muestras de plasma.
  • Fácil de usar: el flujo de trabajo puede ser completado en 2 horas.

 

Este kit se utiliza para identificar a cuál de las dos hebras de ADN pertenece la información del transcrito de ARN. Identificar la hebra original incrementa el porcentaje de lecturas que se ensamblan al transcriptoma y provee una información más exacta para estudios de regulación de expresión de genes y de análisis funcionales. Mantener la orentación de la hebra también permite la identificación de la expresión antisentido y de nuevos genes.

 

APLICACIONES RECOMENDADAS

Tipo muestra Método de enriquecimiento de ARN Longitud de lectura Aplicación

 ARN total eucariótico con una alta integridad

Poly(A)+ mRNA enriquecido mediante oligo(dT) beads

SE50/PE100/PE150

Cuantificación de mRNA y análisis del transcriptoma

 ARN total eucariotico con una alta integridad  rRNA eliminado con rRNA depletion kit  PE100/PE150  Análisis del transcriptoma y del LncRNA
ARN total procariótico rRNA eliminado con rRNA depletion kit PE100/PE150

Cuantificación de ARN y análisis del transcriptoma

Muestras FFPE con el ARN degradado, RNA de plasma cell-free, etc..  rRNA eliminado con rRNA depletion kit SE50/PE100 Cuantificación de ARN y análisis del transcriptoma

 

ESPECIFICACIONES DE PRODUCTO

Nombre del kit MGIEasy RNA Directional Library Prep Set
 Versión  V. 2.0
 Reacciones/ Kit  16 RXN (1000006385),96 RXN (1000006386)
 Cantidad inicial  10 ng - 1µg de ARN total
 Tipo de muestra  Tejido y muestras FFPE
 Compatibilidad de especies  Humana, animales, plantas, hongos y bacterias
 Tiempo de ensayo  7 horas
 Aplicaciones  RNA-seq, secuenciación del transcriptoma, secuenciación del ARN total, secuenciación del LncRNA
 Plataformas compatibles  DNBSEQ-G50, DNBSEQ-G400
 Longitud lectura recomendada  SE50/PE100/PE150
 Datos de secuenciación recomendados por muestra  25M datos crudos (SE50) / 8Gb datos crudos (PE100/PE150)

 

  • Amplio rango de ARN total inicial: compatible con alto rango de ARN total inicial (10ng-1µg) exibiendo una excelente calidad en los datos de secuenciación y en la anotación del transcrito.
  • Excelente cobertura: proporciona un ensamblado de los transcritos correcto y completo.
  • Detección exacta de la orientación de la hebra: identifica el origen del transcrito, detecta transcritos antisentido, mejora la anotación del transcrito.
  • Fácil de usar: protocolo simple y compatible con equipos de preparación de librerías automático.
  • Compatible con varios tipos de muestra: incluyendo ARN de baja calidad, ARN en FFPE y muestras de plasma.
  • Alta uniformidad: proporciona una alta uniformidad de los transcritos desde el extremo 5´al extremo 3´y alcanza una cobertura por encima del extremo 3´.
  • Solución flexible: Existen varios métodos de enriquecimiento de ARN y varias longitudes de lectura para satisfacer las necesidades en todo tipo de muestras.

 

Las librerías preparadas con este kit pueden ser usadas para detectar pequeños ARNs conocidos o desconocidos, así como sus genes diana en muestras humanas, de animales y plantas.

 

ESPECIFICACIONES DE PRODUCTO

Nombre del kit MGIEasy Small RNA Library Prep Kit
 Versión  V. 2.0
 Reacciones/ Kit  24 RXN (1000005269)
 Cantidad inicial  10 ng - 1µg de ARN total
 Tipo de muestra  Tejido
 Compatibilidad de especies  Humana, animales y plantas
 Plataformas compatibles  DNBSEQ-G50, DNBSEQ-G400
 Longitud lectura recomendada  SE50
 Datos de secuenciación recomendados por muestra  25M datos crudos

 

 

  • Baja cantidad de ARN inicial: requiere solamente 10ng de ARN por muestra.
  • Solución flexible: proporciona dos opciones de selección de tamaño, basadas en beads o en purificación en gel para aplicaciones específicas.
  • Compatible con varios tipos de muestras: muestras humanas, de animales y plantas.

 

MGIEasy RNA Exome es una solución para la cuantificación dirigida de las regiones codificantes del transcriptoma humano.

Se basa en la conversión de RNA total en cDNA manteniendo la información de la dirección de la hebra y la captura dirigida de las secuencias de exoma.

Está diseñado especialmente para muestras de ARN degradado, capturando solo las regiones codificantes del ARN total, de esta manera mejora la exactitud en la cuantificación del ARN mensajero.

MGIEasy RNA Exome incluye MGIEasy RNA Directional Library Prep Set, MGIEasy Exome Capture V5 Probe Set y MGIEasy Exome Capture Accessory Kit.

 

ESPECIFICACIONES DE PRODUCTO

Nombre del kit MGIEasy RNA Exome
   
 Reacciones/ Kit  16 RXN
 Cantidad inicial  10 – 100 ng de ARN total
 Tipo de muestra  Tejido fresco congelado, muestras FFPE
 Compatibilidad de especies  Humana
Tiempo de ensayo  32 horas
  Plataformas compatibles  DNBSEQ-G50, DNBSEQ-G400
 Longitud lectura recomendada  PE100
 Datos de secuenciación recomendados por muestra  25M lecturas

 

  • Baja cantidad inicial de muestra: requiere 10 ng de ARN total.
  • Compatible con muestras degradadas: se obtiene una alta calidad en los resultados de muestras FFPE y otros tipos de muestras degradadas.
  • Enfocado en la region codificante del ARN: la captura dirigida de regiones del exoma humano a partir de ARN total requiere menos cantitad de datos para alcanzar la misma profundidad de secuenciación en las regiones diana.
  • Alta reproducibilidad: La reproducibilidad de muestras de baja calidad está por encima del 0.99.

 

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