Cáncer hereditario y Cáncer

Bioo Scientific ofrece una amplia gama de paneles para tecnología NGS tanto para plataformas Illumina como Ion Torrent en el área de oncología.

La secuenciación por amplicones se basa en una secuenciación de alta profundidad de productos de PCR para el análisis de variantes genéticas y las diferencias de expresión génica. Bioo Scientific ofree tanto kits validados a medida como kits prediseñados para resecuenciación dirigida. Permitiendo a los investigadores que se centren en regiones claves de  interés con flujo de trabajo sencillo.

Los paneles NEXTflex ™ amplicón permiten a los investigadores secuenciar un gran número de regiones de genes específicos de muestras seleccionadas para el análisis de los puntos calientes de una mutación dentro de un subconjunto de  genes o la detección de variaciones del número de copias (CNV), fusiones de genes bien definidos y SNPs. Los paneles de RNA están diseñados para detectar diferencias en los niveles de RNA de genes de interés Nuestros kits son fácilmente escalables, rentables, rápidos que se pueden aplicar a una amplia gama de organismos y/o genes.

Los paneles NEXTflex incluyen cebadores que flanquean las regiones de interés, reactivos de preparación de la biblioteca, y códigos de barras necesarios para la construcción de librerias compatibles con las plataformas de secuenciación de Illumina. La secuenciación de amplicones  se basa en una secuenciación de alta profundidad de productos PCR paya el studio de variaciones genéticas y diferencias de expresión.

 

PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS

  • Cobertura 100% del exón  y zonas que flanquean intron-exon.
  • Alta uniformidad de las secuencias diana de lectura.
  • Hasta 384 barcodes que permiten una alta capacidad multiplex.
  • 20 ng DNA de muestra  fresca o congelada para detección de mutaciones germinales.
  • 40 ng de DNA aislado de muestras de FFPE.

 

BENEFICIOS

  • Protocolos rápidos y sencillos.
  • El diseño modular permite la adopción rápida de múltiples paneles que se pueden ejecutar en el mismo cartuch.

 

Más información en la web de Bioo Scientific

Documentación relacionada

Gamas

Los paneles BRCA1 y BRCA2 permiten rápidamente secuenciar todos los exones de BRCA1 y BRCA2.

El kit contiene todas las parejas de primers y reactivos para amplificar las secuencias codificantes de  BRCA1 y BRCA2 y preparar las librerías para secuenciar con plataforma Illumina y Ion Torrent.

 

Más información en la web de Bioo Scientific

  • Cobertura completa de BRCA1 y BRCA2.
  • 100% de uniformidad de todos los exones y regiones intrónicas adyacentes.
  • Para muestras FPPE 99% de uniformidad de todos los exones y zonas que flanquean intron-exon.
  • Protocolos validados de 2 horas con bajo input de muestra.
  • Para mutaciones germinales permite el multiplexado de 384 muestras cin una cobertura 100xy para la detección de mutaciones somáticas 14 muestras con cobertura 2000x en una carrera 2x300Miseq.
  • Bajo input. 20ng de tejido fresco o congelado o sangre. Para tejido FPPE 40ng.

 

Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.

Lo paneles BRCA1 y BRCA2 permiten rápidamente secuenciar 80 exones de BRCA1, BRCA2, PALB2 y CHEK2.

El kit contiene todas las parejas de primers y reactivos para amplificar las secuencias codificantes y preparar las librerías para secuenciar con plataforma Illumina y Ion Torrent.

 

Más información en la web de Bioo Scientific

  • Cobertura completa de BRCA1, BRCA2, PALB2 y CHEK2. Exones y regiones intrónicas adyacentes.
  • 97% de uniformidad de todos los amplicones con cobertura 0.2x; 100de amplicones detectados con cobertura media de 0.1x.
  • Protocolos validados de 2 horas con bajo input de muestra.
  • Para mutaciones germinales permite el multiplexado de 384 muestras con una cobertura  en una carrera 2x300Miseq.
  • 20ng de tejido fresco o congelado o sangre.

 

Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.

Permite la secuenciación rápida de 36 exones de locus   MLH1 y MSH2  Contiene los primers y los reactivos necesarios para amplificar estas regiones codificantes d MLH1 y MSH2  el  a partir de tejido fresco o congelado.

El panel  se puede suministrar con 384 barcodes. El panel tiene capacidad de multiplexado de 700 muestras con una cobertura 100x para detección de mutaciones germinales en una sola línea de 2x300MiSeq.

 

Más información en la web de Bioo Scientific

 

  • Cobertura 100%  del exón MLH1 y MSH2  y zonas que flanquean intron-exon.
  • 99% uniformidad de amplicones con cobertura 0.2, 100% de amplicones detectados con cobertura media de 0.1X.
  • 384 barcodes disponibles.
  • Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.
  • Bajo input: 20ng DNA de muestra tanto en tejido fresco como congelado.

Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.

Permite la secuenciación rápida de 25 exones de locus    the MSH6 y  PMS2 Contiene los primers y los reactivos necesarios para amplificar estas regiones codificantes d MSH6 y  PMS2 el  a partir de tejido fresco o congelado.

El panel  se puede suministrar con 384 barcodes. El panel tiene capacidad de multiplexado de 560 muestras con una cobertura 100x para detección de mutaciones germinales en una sola línea de 2x300MiSeq.

 

Más información en la web de Bioo Scientific

  • Cobertura 100%  del exón MSH6 y  PMS2 y zonas que flanquean intron-exon.
  • 100% uniformidad de amplicones con cobertura 0.2.
  • 384 barcodes disponibles.
  • Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.
  • Bajo input: 20ng DNA de muestra tanto en tejido fresco como congelado.

 

Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.

Permite la secuenciación de zonas codificantes de locus CEBPA. Contiene los primers y los reactivos necesarios para amplificar estas regiones codificantes del CEBPA a partir de tejido fresco o congelado.

El panel NexflexCEBPA se puede suministrar con 384 barcodes. El panel tiene capacidad de multiplexado de 500 muestras con una cobertura 100x para detección de mutaciones germinales en una sola línea de 2x300MiSeq.

 

Más información en la web de Bioo Scientific

  • Cobertura 100%  del exón CEBPA y zonas que flanquean intron-exon.
  • 100% uniformidad de amplicones con cobertura 0.2.
  • 384 barcodees disponibles.
  • Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.
  • Bajo input: 20ng DNA de muestra tanto en tejido fresco como congelado.

 

Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.

Bioo ofrece u un panel validado de amplicones con cobertura a los RAD51D, RAD51C, and BRIP1 a partir de muestras frescas o congeladas para secuenciadores Illumina .Para estudios en cáncer de ovario.

El panel  se puede suministrar con 384 barcodes. El panel tiene capacidad de multiplexado de 280 muestras con una cobertura 100x para detección de mutaciones germinales en una sola línea de 2x300MiSeq.

 

Más información en la web de Bioo Scientific

  • Cobertura 100% del exón RAD51D, RAD51C, y BRIP1 y zonas que flanquean intron-exon.
  • 100% uniformidad de amplicones con cobertura 0.1x.
  • 99% uniformidad de amplicones con cobertura 0.2x.
  • 384 barcodees disponibles.
  • Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.
  • Bajo input: 20ng DNA de muestra tanto en tejido fresco como congelado.

Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.

Permite la secuenciación rápida de 38 exones de locus  PALB2, BARD1 y TP53 genes vitales para la investigación de genes de cáncer de mama y síndrome de cáncer de ovarios (HBOC) Contiene los primers y los reactivos necesarios para amplificar estas regiones codificantes del PALB2, BARD1 y TP53  a partir de tejido fresco o congelado.

El panel  se puede suministrar con 384 barcodes. El panel tiene capacidad de multiplexado de 700 muestras con una cobertura 100x para detección de mutaciones germinales en una sola línea de 2x300MiSeq.

 

Más información en la web de Bioo Scientific

  • Cobertura 100%  del exón PALB2, BARD1 y TP53  y zonas que flanquean intron-exon.
  • 100% uniformidad de amplicones con cobertura 0.2.
  • 384 barcodes disponibles.
  • Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.
  • Bajo input: 20ng DNA de muestra tanto en tejido fresco como congelado.

Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.

Permite la secuenciación rápida de 105exones de locus  de 21 genes diferentes. Contiene los primers y los reactivos necesarios para amplificar estas regiones codificantes del gen a partir de material fresco o congelado.

El panel  se puede suministrar con 384 barcodes. El panel tiene capacidad de multiplexado de 4 muestras con una cobertura 2000x para detección de mutaciones somaticas en una sola línea de 2x300MiSeq.

Gen Región de cobertura

ASXL1

Exon 12

CALR

Exon 9

CEBPA

All CDS*

CSF3R

Exon 14, 17

DNMT3A

All CDS*

EZH2

All CDS*

FLT3

Exon 14-15, 20

IDH1

Exon 4

IDH2

Exon 4

JAK2

Exon 12, 14

JAK3

Exon 13

KIT

Exon 2, 8-11, 13, 17

MPL

Exon 10

NPM1

Exon 11

RUNX1

All CDS*

SETBP1

Exon 4 (hotspot)

SF3B1

Exon 13-16

SRSF2

Exon 2

TET2

Exon 3-11

TP53

Exon 2-11

U2AF1

Exon 2, 5, 6

 

Más información en la web de Bioo Scientific

  • Cobertura 100% del 105 exones seleccionados de 21 diferentes genes y zonas que flanquean intron-exon.
  • 95 % uniformidad de amplicones con cobertura 0.2x; 99% de amplicones detectados con cobertura media >0.1X.
  • 384 barcodes disponibles.
  • Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.
  • Bajo input: 20ng DNA de muestra  fresca como congelada.

Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.

Permite la secuenciación rápida de 12exones de locus   TP53  Contiene los primers y los reactivos necesarios para amplificar estas regiones codificantes d TP53  el  a partir de tejido fresco o congelado.

El panel  se puede suministrar con 384 barcodes. El panel tiene capacidad de multiplexado de 3000 muestras con una cobertura 100x para detección de mutaciones germinales en una sola línea de 2x300MiSeq.

 

Más información en la web de Bioo Scientific

  • Cobertura 100%  del exón TP53  y zonas que flanquean intron-exon.
  • 100% uniformidad de amplicones con cobertura 0.2.
  • 384 barcodes disponibles.
  • Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.
  • Bajo input: 20ng DNA de muestra tanto en tejido fresco como congelado.

Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.

Permite la secuenciación rápida de los exones de locus   TP53  Contiene 27primers y los reactivos necesarios para amplificar estas regiones codificantes d TP53  el  a partir de tejido embebido en parafina

El panel  se puede suministrar con 384 barcodes. El panel tiene capacidad de multiplexado de 50 muestras con una cobertura 2000x para detección de mutaciones somaticas en una sola línea de 2x300MiSeq.

 

Más información en la web de Bioo Scientific

  • Cobertura completa del  TP53.
  • 99 % uniformidad de todos los exones codificantes y zonas flanqueantes, validadas en muestras de DNA embeidad en parafina.
  • Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.
  • Bajo input: 40ng DNA de muestra tanto en tejido FPPE.

Solución completa: Los paneles se ofrecen con el diseño de los primers, reactivos para preparación de librerías, reactivos de amplificación y los barcodes para multiplexar.

Top