Diagnóstico

Tipaje HLA por NGS. NXType NGS kit

Obtención de tipaje de alta resolución mediante NGS (Next Generation Sequencing) mediante un proceso sencillo y rápido. Dando soporte integral tanto a los reactivos como equipos.

Obtención de tipaje de alta resolución mediante NGS (Next Generation Sequencing).  

PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS

  • Long Range PCR.
  • Kits multiplex para clase I y clase II que permiten amplificar clase I (loci A, B y C) en un único pocillo, al igual que la clase II (loci DRB1, DRB3, DRB4, DRB5, DQB1 y DPB1).
  • Kits singleplex para la amplificación de DQA1 y DPA1.
  • Exones que se secuencian.
    • Loci A, B y C: Gen completo.
    • Locus DRB1: Exon 2 – Intron 3.
    • Locus DRB345: Exon 2 – Intron 3.
    • Locus DQB1: Exon 2 – Intron 3.
    • Locus DPB1: Exon 2 – 3ˈ UTR.
    • Locus DQA1: Gen completo.
    • Locus DPA1: Gen completo.
  • Mezcla de amplicones para preparar una única librería con todos los loci.
  • Permite procesar hasta 96 muestras simultáneamente.
  • Secuenciación mediante tecnología Ion Torrent, en plataformas PGM y Ion S5.
  • Sencillez y rapidez. Resultados en menos de 3 jornadas de 8 horas (laboratorios a jornada completa pueden obtener los resultados en menos de 24 horas).

  • Software de análisis TypeStreamTM:
    • Algoritmo de tipaje HLA y asignación de variantes preciso, con una concordancia del 99,5%.
    • Genotipado automático, reduciendo el tiempo hasta la obtención de los resultados.
    • Conjunto completo de herramientas de análisis:
      • Revisar resultados.
      • Navegar por las secuencias mapeadas.
      • Identificar nuevas mutaciones.
      • Evaluar la cobertura y profundidad.
      • Reanalizar “runs”.

  • Secuenciador Ion S5: secuenciación de 96 muestras en 5 horas.
  • Ion Chef para la preparación del template y carga en el chip.
  • One Lambda da soporte al proceso completo: reactivos, instrumentos y software.

REFERENCIAS

Referencia Descripción Formato
NXT1ABC Loci A, B y C 96 tests
NXT2RQP1X Loci DRB1, DRB345, DQB1 y DPB1 96 tests
NXT2QA1X Locus DQA1 24 tests
NXT2PA1X Locus DPA1 24 tests

 

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